Exploración de comunidades rizobacterianas y aislamiento de bacterias con características PGPR a partir de la rizósfera de suelos chilenos provenientes del desierto de Atacama, la estepa patagónica y la región de La Araucanía [recurso electrónico] / Joaquín Ignacio Rilling Tenorio ; profesor guía : Milko Alberto Jorquera Tapia.

Incluye índice, figuras, tablas, anexos

Tesis : (Biotecnólogo).-- Universidad de La Frontera, Facultad de Ciencias Agropecuarias y Medioambiente, 2014.

Bibliografía

En los distintos tipos de suelos, es posible encontrar bacterias simbiontes que promueven el crecimiento vegetal, las cuales pueden ser asociadas a todos los tipos de plantas, denominadas PGPR (del inglés Plant Growth Promoting Rhizobacteria). Este tipo de bacterias contribuye al desarrollo de las plantas mediante diversos mecanismos. Chile cuenta con una amplia variedad de ambientes, presentándose de norte a sur, entre los que encontramos: Desérticos, mediterráneos, templado-lluviosos, oceánicos y semi-aridos. Sin embargo, aquellos ambientes deficientes en términos agronómicos no son estudiados en profundidad debido al poco interés productivo que estos presentan a nivel de suelo. Asimismo ambientes que si son productivos agronómicamente se están viendo afectados por la disminución en el rendimiento de los suelos, a causa del uso intensivo de fertilizantes químicos, principalmente en base a P y N. Por otra parte, el cambio climático ejerce su efecto año a año de manera paulatina, incrementando cada vez más el estrés abiótico en plantas a través de sequía, aumentos de temperatura, salinidad, erosión y otros. Los objetivos de este trabajo fueron estudiar la composición y estructura de las comunidades rizobacterianas dos suelos con carácter árido (Desierto de Atacama y estepa Patagónica), en contraste con suelos fértiles de Chile (Región de La Araucanía), y aislar desde estos bacterias con características PGPR productoras de las enzimas BetaPGPR Beta -pro peller fitasa y peller fitasa y 1-aminociclopropano-1-carboxilato deaminasa. Ambos objetivos fueron llevados a cabo mediante el uso de técnicas microbiológicas (uso de medios de cultivo selectivos) y de biología molecular (PCR, DGGE y secuenciación). A partir de los experimentos realizados, el análisis DGGE revelo la composición de las comunidades rizobacterianas correspondientes a cada rizósfera muestreada, encontrándose la presencia de los órdenes Enterobacteriales, Actinomycetales y Rhizobiales en todos los ambientes. Es así como también mediante nMDS se encontraron diferencias en la estructura de las comunidades rizobacterianas de los tres ambientes estudiados. Respecto a la presencia de PGPR, 25 aislados bacterianos provenientes desde todos los ambientes explorados reportaron la presencia de uno o ambos genes de interés para éste estudio. Todos los aislados obtenidos fueron capaces de producir fitohormona, ácido indol-3 acetico bajo condiciones de laboratorio.